More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0604 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
146 aa  290  5e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  31.88 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  27.07 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  31.65 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  29.71 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  21.77 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
176 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
168 aa  60.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  23.24 
 
 
172 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  25.18 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  31.53 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.71 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 
172 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  28.15 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  34.44 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  34.44 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  34.44 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  34.44 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  34.44 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  34.44 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  34.44 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  30.7 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  34.44 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  27.41 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  30.17 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 
296 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  36.67 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  36.67 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  23.36 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  24.11 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  22.06 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
164 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  28.23 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  35.56 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
137 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  32.98 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  30.66 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  21.5 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  29.2 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
150 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
177 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
166 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
151 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
165 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  34.44 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  25.25 
 
 
167 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0987  transcriptional regulator  35.94 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000387404  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  34.44 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>