More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7499 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  343  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  57.34 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  56.64 
 
 		 150 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  42.48 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 190 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 148 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 161 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 188 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 176 aa  94  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 151 aa  92.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 315 aa  87.8  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 140 aa  84.3  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  37.01 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.71 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.71 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.71 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.71 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.71 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  30.47 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  25.93 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.58 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>