More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6455 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.05 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  31.58 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.72 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  27.07 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  28.15 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  27.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  30.77 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4084  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0692551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 315 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  22.54 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 304 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>