291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5242 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  324  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  324  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  99.38 
 
 
162 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  96.3 
 
 
179 aa  292  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  95.68 
 
 
185 aa  290  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  94.44 
 
 
162 aa  285  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  60.14 
 
 
155 aa  187  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 
158 aa  184  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 
157 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  44.97 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
148 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
169 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
150 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
161 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
151 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  42.07 
 
 
177 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 
150 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
178 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
205 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
303 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
137 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.6 
 
 
134 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
201 aa  61.6  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
135 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 
140 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.85 
 
 
134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.85 
 
 
134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.85 
 
 
134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.85 
 
 
134 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
141 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
169 aa  57.4  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
141 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
179 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  29.32 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
141 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  34 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>