More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3696 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
170 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
303 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  40.8 
 
 
177 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
315 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
184 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
172 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
189 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
190 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
161 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
167 aa  70.1  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  38.53 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  35.71 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
185 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
179 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
162 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
195 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
205 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  41.03 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  35.19 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
158 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
162 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
162 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  35.79 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  30.58 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>