More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0223 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
169 aa  340  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.99 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
163 aa  88.2  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  38.41 
 
 
178 aa  85.5  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  37.67 
 
 
171 aa  84  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  35.51 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.06 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
193 aa  80.5  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  32.39 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  40 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  30.83 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
161 aa  72  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 
142 aa  72  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  43.02 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  30.07 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
138 aa  63.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
149 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 
139 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
150 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
151 aa  60.8  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
165 aa  60.8  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
142 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
142 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
142 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  44.78 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
139 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  36.84 
 
 
145 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
139 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
303 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
139 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
146 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  38.1 
 
 
160 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
148 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>