212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5296 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  32.35 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  24.31 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  23.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 183 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  26.47 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  25.37 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  36.47 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  21.99 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  25.41 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  20.59 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  30.08 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  23.08 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  29.82 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  24.24 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  21.05 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  21.28 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  24.09 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  24.11 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  22.73 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>