More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4426 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  316  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3525  transcriptional regulator, MarR family  75.66 
 
 		 155 aa  244  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  39.74 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  43.8 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.69 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  34.44 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 326 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 326 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 326 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  33.66 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  32.11 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 326 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  27.52 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 321 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.07 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  24.11 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  31.46 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.75 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.74 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.76 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>