More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3592 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  303  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  51.03 
 
 
156 aa  163  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3525  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 
152 aa  147  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  42.75 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  40.88 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  27.52 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 
170 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  27.59 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
155 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
154 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  23.02 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
153 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 
161 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  34.72 
 
 
139 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  34.72 
 
 
139 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  30.61 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
160 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  29.35 
 
 
195 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  26.47 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.45 
 
 
152 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  19.38 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
136 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 
150 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 
150 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.01 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.01 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  24.21 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
159 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
159 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  29.33 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 
154 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  21.74 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  25.38 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>