More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0150 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  310  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  32.82 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  30.16 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  27.7 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  27.48 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  23.13 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.88 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 197 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.09 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  26.36 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>