More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1859 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
157 aa  294  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  83.44 
 
 
157 aa  228  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  62.32 
 
 
165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 
167 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
157 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  58.73 
 
 
150 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  55.04 
 
 
150 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  57.94 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  47.74 
 
 
159 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  49.31 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
159 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
159 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  47.89 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  47.74 
 
 
159 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  47.4 
 
 
202 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  53.17 
 
 
154 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
159 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
159 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  46.32 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  46.98 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  52.45 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5463  MarR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0475431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  48.28 
 
 
210 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
145 aa  93.6  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2319  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
159 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
143 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  36.72 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  40 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  40 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  40 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  40 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  40 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  35.94 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  35.94 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  46.23 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  41.38 
 
 
144 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  39.13 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  35.16 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  38.26 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  35 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  35.34 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  37.5 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  37.5 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  37.5 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
169 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  38.89 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  37.5 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  38.21 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  38.84 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  38.84 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  43.96 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  36.52 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  36.52 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  39.08 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>