More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3482 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  337  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 		 144 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 144 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  42.14 
 
 		 148 aa  87.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 145 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 145 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 145 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 145 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  44.64 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  44.64 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  40.21 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  40.21 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  40.21 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  39.18 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  39.18 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  41.57 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  41.57 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2319  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  41.57 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  41.57 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  41.57 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  41.57 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  41.57 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  38.14 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  38.2 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  40.45 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  27.54 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  35.96 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  33.6 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  44.71 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>