260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3704 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  41.22 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  35.34 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  36.81 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  34.81 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  36.63 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  34.11 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  32.41 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  32 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  36.51 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.09 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  24.65 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  25.93 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 155 aa  47.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  29.77 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  25.56 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  34.15 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  33.91 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  25.56 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>