More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1908 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  322  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  48.17 
 
 		 219 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  51.23 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  47.56 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  46.95 
 
 		 213 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  47.97 
 
 		 208 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  40.91 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40.88 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  34 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  37.8 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 296 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  29.69 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.69 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  31.4 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.92 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 292 aa  57  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  50.77 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  33.7 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  28.77 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  29.69 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  36 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  31.52 
 
 		 109 aa  51.6  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  21.64 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.97 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.56 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32.56 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  30.3 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  32.56 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32.56 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  29.01 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  27.91 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>