95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3454 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  339  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  32.84 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 151 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  24.07 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  27.07 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 205 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  21.52 
 
 		 162 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  24.44 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0092  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  24.35 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2971  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  27.69 
 
 		 208 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  25 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 321 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  25 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  22.86 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  33.77 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 146 aa  42  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 149 aa  42  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 149 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 138 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  23.24 
 
 		 158 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 158 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 149 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 165 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  24.6 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  25.97 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>