183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1381 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  288  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  36.43 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  39.53 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.88 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  34.31 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 193 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  33.01 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04625  transcriptional regulator MarR family  42.11 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.25 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.64 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  28.1 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.63 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 161 aa  50.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  28.91 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  28.95 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 303 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  31.73 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  28.43 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>