72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04625 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04625  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 157 aa  299  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.59 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  35.34 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.63 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.04 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.69 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  29.69 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  30.23 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  29.01 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 154 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  32.63 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30.97 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  28.46 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>