More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2611 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
160 aa  323  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  35.58 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.17 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
148 aa  54.3  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
149 aa  53.9  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
197 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
178 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  34.44 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
141 aa  52  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
145 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0360  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
212 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
212 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
212 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
212 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  30.25 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  30.92 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
212 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
212 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>