More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0136 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  303  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 151 aa  186  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 171 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  32.26 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  37.19 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  33.65 
 
 		 174 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  29.92 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  42.86 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  31.33 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  34.62 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  30.21 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  51.06 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>