114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0281 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  32.72 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  29.61 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  26.21 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 147 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  37.04 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  30.89 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 148 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  30.13 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  28.77 
 
 		 154 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 157 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  30.52 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  44.7  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2225  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.666474  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  29.57 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 321 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 140 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 146 aa  42  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  40.58 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  25.33 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>