More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0075 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  36.79 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  31.87 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  33.65 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  37.62 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  29.93 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  29.6 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  31.25 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  31.25 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  27.21 
 
 		 138 aa  51.2  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 192 aa  50.8  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  33.04 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  29.03 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 314 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 		 306 aa  48.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 352 aa  48.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  39.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 134 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 322 aa  47.8  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 149 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 153 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>