293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3538 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  100 
 
 		 153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  43.65 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  38 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.1 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  39.13 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  29.25 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35.86 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  36.79 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  33.68 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  30 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  41.76 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  31.07 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  46.3 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>