287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7503 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  310  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  58.94 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  46.05 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  44.53 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  45.22 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 162 aa  84  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  34.34 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  32.1 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  30.94 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 334 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2286  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  31.88 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  31 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.74 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  25.25 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>