206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4279 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  329  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7125  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  24.6 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  28.95 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  21.9 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  30.3 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  27.86 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2146  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 211 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  0.322548 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  25.81 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  27.43 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  28.93 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2219  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.49 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.49 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.49 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.49 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.49 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  30.23 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  26.02 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  29.87 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  25.9 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  29.91 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  29.07 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 142 aa  43.9  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  31.13 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.74 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.74 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.74 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  29.27 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>