188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6524 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  296  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  52.99 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 144 aa  121  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  29.58 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  33.68 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  23.62 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  32.52 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  22.9 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  31.3 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  31.25 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  29.03 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 312 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  38.24 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  43.1 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  47.06 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  40.32 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 161 aa  43.5  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 174 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>