112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3350 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  98.78 
 
 
188 aa  323  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  83.13 
 
 
186 aa  261  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  84.62 
 
 
166 aa  260  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  82.12 
 
 
193 aa  247  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  75.95 
 
 
161 aa  238  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  71.07 
 
 
168 aa  217  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  70.51 
 
 
165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  67.55 
 
 
179 aa  203  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  51.37 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
144 aa  57.8  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
128 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  31.86 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
146 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
162 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  53.49 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  40 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  31.37 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
139 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
170 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  33.64 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
184 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  37.5 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  37.29 
 
 
261 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  30.11 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  23.45 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  27.72 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
167 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 
127 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  39.06 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  29.79 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
158 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
172 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
177 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
149 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 
150 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
151 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  30.95 
 
 
169 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
185 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>