70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3949 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  65.41 
 
 		 161 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 165 aa  207  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  68.46 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  67.55 
 
 		 164 aa  203  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 188 aa  201  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  62.8 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 128 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 144 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 144 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 144 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  34.33 
 
 		 261 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  42.37 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  32.91 
 
 		 137 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 162 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  37.88 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  39.39 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  31.87 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 158 aa  42  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.7 
 
 		 291 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 156 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.23 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  26.92 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 144 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 144 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  40.66 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  45.28 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>