50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0282 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  317  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  32.12 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  31.06 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2853  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1191  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2630  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0297  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 165 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 151 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 155 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 172 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0524  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0172488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  28.97 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  31.36 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>