More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6596 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 140 aa  282  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  52.31 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  36.44 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  39.13 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  53.06 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.13 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.13 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  34.94 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.13 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.13 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  37.74 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  28.12 
 
 		 138 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 244 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  22.79 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  34.51 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.67 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 138 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 138 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 138 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 138 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  29.29 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>