100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4190 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  306  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  70.25 
 
 		 159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  63.5 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  46.26 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  46.05 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  23.15 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 313 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 334 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 320 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  31.52 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 347 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 340 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 326 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 340 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.81 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 309 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 349 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 347 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  29.03 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 175 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  25.78 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0283  hypothetical protein  41.51 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000125013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  30.49 
 
 		 140 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  22.66 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>