120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3565 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  330  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1670  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000203174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  36.14 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 138 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  23.21 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 313 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 220 aa  45.1  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  23.76 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 158 aa  43.9  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 156 aa  43.9  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 		 187 aa  43.9  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  42.62 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  30.28 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  22.79 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  44.26 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 352 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  28.72 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 161 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 150 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 151 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2268  regulatory protein, MarR  31.63 
 
 		 159 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 337 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>