82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0508 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  37.75 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  44.04 
 
 
153 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
149 aa  97.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
146 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  43.12 
 
 
153 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
146 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
156 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
181 aa  87.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
156 aa  84  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  29.69 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  25.89 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
147 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0270  transcriptional regulator  20.39 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  26.36 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  24.6 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  23.15 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  26.97 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  22.41 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
152 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
139 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 
156 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
140 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  22.41 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  27.78 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  22.12 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  25.64 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  25.27 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
312 aa  40.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>