110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0646 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
161 aa  333  5.999999999999999e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  55 
 
 
159 aa  160  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
165 aa  84  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  31.82 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  29.82 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
220 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  57.8  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  25.23 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0948  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  27.59 
 
 
135 aa  50.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 
208 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  27.27 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
181 aa  48.5  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
139 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4672  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 
320 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
152 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  34.33 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
103 aa  43.9  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  21.62 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2420  transcriptional regulator  30.4 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  22.95 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 
104 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
329 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  22.35 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 
152 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
161 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
347 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  22.35 
 
 
155 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
98 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.66 
 
 
349 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
156 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
349 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
141 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  28.87 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>