189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1596 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  317  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
176 aa  57.4  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  22.07 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
154 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
152 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2360  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00354058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
198 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  19.47 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  26.13 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  28.74 
 
 
178 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
145 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
167 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
326 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
174 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  23.23 
 
 
159 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1786  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
161 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
336 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  19.3 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  21.7 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  27 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
352 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.54 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  22.78 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  30.23 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.58 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  24.72 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
310 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
334 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  27.27 
 
 
290 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
190 aa  44.3  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.25 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  22.73 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  51.16 
 
 
163 aa  44.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  32.88 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  32.88 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  32.88 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>