47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2360 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2360  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
160 aa  330  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00354058  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06420  transcriptional regulator  37.37 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  24.17 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  21.58 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  24.42 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  33.85 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 
183 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
142 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  28.67 
 
 
166 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
168 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
207 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  36.62 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
142 aa  41.2  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  28.04 
 
 
178 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  32.26 
 
 
167 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
143 aa  40.8  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 
145 aa  40.8  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  36.14 
 
 
171 aa  40.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  36.14 
 
 
171 aa  40.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 
162 aa  40.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>