More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2005 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  332  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.38 
 
 		 316 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.07 
 
 		 314 aa  91.3  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 		 327 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.19 
 
 		 338 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 345 aa  84.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.25 
 
 		 318 aa  84  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.63 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3540  regulatory protein MarR  26.77 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.074778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  28.7 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 315 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  32.08 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 324 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  30.3 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  30.26 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  26.58 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.78 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  25.98 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  29.89 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  31.82 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  24.62 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4367  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  43.14 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>