83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2670 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
147 aa  295  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
159 aa  92  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 
220 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
220 aa  54.7  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
156 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
174 aa  50.4  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
150 aa  50.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  26.67 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  25.29 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
152 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
152 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
313 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  21.79 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  26.92 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  24.35 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  27.87 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
334 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
173 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>