200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2503 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  94.23 
 
 
156 aa  301  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  93.59 
 
 
156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  73.08 
 
 
157 aa  235  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  69.87 
 
 
157 aa  227  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  68.46 
 
 
155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
157 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  42.37 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  41.53 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  41.53 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  40.57 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  30.11 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  26.67 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  28.12 
 
 
141 aa  57.4  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  31.71 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  21.82 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  30.11 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  17.5 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
140 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  26.97 
 
 
167 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 
157 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  24.49 
 
 
158 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
139 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
322 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  21.82 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  21.82 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>