191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2555 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 154 aa  84.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  35.61 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 220 aa  70.5  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  26.81 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  41.07 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  27.19 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  27.19 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  23.94 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  33.7 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  27.07 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2438  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0147393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  30.53 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  34.43 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  24.19 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.51 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2216  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.103623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>