142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1029 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  73.89 
 
 		 157 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  71.15 
 
 		 156 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  68.59 
 
 		 156 aa  227  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  69.87 
 
 		 156 aa  227  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  67.95 
 
 		 155 aa  211  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 153 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  28.57 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 183 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  31.65 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  26.74 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  24.59 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  25.97 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0270  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  44.7  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  22.43 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2420  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  21.67 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>