More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3376 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
141 aa  287  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  49.22 
 
 
136 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
136 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  48.44 
 
 
136 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  48.44 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  48.44 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1623  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
182 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
156 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  25.93 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  36.56 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
150 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
163 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  28.04 
 
 
191 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07740  transcriptional regulator  30.7 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.339553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 
208 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  30.3 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
190 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 
146 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  25 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  28.18 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.84 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 
149 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
151 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  25.51 
 
 
171 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
169 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  30.93 
 
 
173 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
160 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
170 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>