125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07740  transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.339553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 322 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.69 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  30.7 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.72 
 
 		 283 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 352 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.63 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.63 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 340 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 340 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.85 
 
 		 287 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  32.43 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3178  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 326 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  29.76 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  39.22 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 160 aa  42  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 168 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 326 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 147 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 179 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 142 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 176 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 314 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  26.73 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  28.38 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  29.89 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  27.71 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>