More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2156 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0297  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2630  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1191  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2853  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2588  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  34.88 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 176 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 176 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  30.12 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.76 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  28.89 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  29.03 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  30.89 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  38.55 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.31 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.68 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.79 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  30.59 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  26.79 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  26.79 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.68 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.68 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.68 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.68 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>