112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1191 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1191  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2853  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2630  MarR family transcriptional regulator  98.64 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  70.07 
 
 		 150 aa  220  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0297  MarR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 147 aa  211  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  72.26 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2588  MarR family transcriptional regulator  69.92 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3891  hypothetical protein  26.36 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  29.75 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  33.06 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  33.96 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  36.73 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  40.26 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 143 aa  43.9  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  32 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 196 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 166 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  26.51 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  32.23 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 172 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 188 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 157 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 176 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.53 
 
 		 144 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.53 
 
 		 144 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.53 
 
 		 144 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.53 
 
 		 144 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.53 
 
 		 144 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2045  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  36.17 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  24.32 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 175 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  37.14 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 170 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 180 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>