115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3505 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  300  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  72.46 
 
 		 146 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1191  MarR family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 147 aa  206  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2853  MarR family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 147 aa  206  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2630  MarR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 147 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0297  MarR family transcriptional regulator  63.01 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2588  MarR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 169 aa  163  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  35.44 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3891  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  41.98 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  33.06 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  38.04 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.83 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  24.78 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  27.03 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  31.62 
 
 		 324 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 167 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  37.04 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 144 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  29.35 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  26.09 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 186 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  36.99 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>