More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1952 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  320  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 323 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 324 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.79 
 
 		 338 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.62 
 
 		 318 aa  57  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  25.51 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.23 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.67 
 
 		 319 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  19.74 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  34.21 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  34.12 
 
 		 324 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.06 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  44.62 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  34.62 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 345 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0374  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 250 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  44.23 
 
 		 283 aa  47.4  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.36 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  35.82 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 303 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  25.85 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.42 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  35.56 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2290  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000698981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2332  regulatory protein MarR  28.77 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 127 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>