More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3493 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  308  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  56.38 
 
 
152 aa  179  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  37.59 
 
 
162 aa  96.7  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  43.2 
 
 
151 aa  92  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
167 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  35.81 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.03 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  32.11 
 
 
162 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  32.26 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
163 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  30.63 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
144 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
170 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
151 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
171 aa  51.2  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
200 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  35.53 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
219 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
299 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
179 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  52 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  24.84 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  52 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.67 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>