130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0419 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06420  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  31.78 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  31.82 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2216  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.103623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2360  transcriptional regulator, MarR family  24.17 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00354058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2438  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0147393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.36 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  25.62 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  20.75 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  20.75 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  31.73 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  31.34 
 
 		 174 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  21.65 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 193 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 147 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 145 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 169 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  29.69 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 160 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  25.19 
 
 		 160 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 163 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.41 
 
 		 308 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 		 175 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>