More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0270 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  280  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  44.68 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  40.3 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 198 aa  89.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 176 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  39.67 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 167 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  43.69 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  35.78 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  45.13 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  39.66 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  47.3 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  32.61 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  50.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 178 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 178 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  24.58 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  31.53 
 
 		 177 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>