289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9046 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  49.32 
 
 		 204 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  39.29 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  40.29 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  44.86 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  35.77 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  33.04 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  25.74 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  31.15 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 212 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.09 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  29.52 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  29.77 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  35.34 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  33.71 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  27.62 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>